«Ноев ковчег»: в МГУ заработал уникальный депозитарий живых систем
В МГУ имени М.В. Ломоносова заработала информационная система в рамках проекта «Ноев ковчег», которая содержит данные об образцах из биологических коллекций университета и партнеров проекта. Как сообщает пресс-служба вуза, аналогов подобной информационной системы, позволяющей оперировать информацией о биологических образцах самой разной природы, а также управлять хранилищами биоматериала, в мире не существует.
Представленные в системе данные и организмы уже активно используются в работе учеными-участниками проекта «Ноев ковчег». Ученые МГУ создают для каждого образца паспорт, содержащий информацию о живом организме.
«Важно не только присутствие образца в коллекции, но и его подробное описание: что это за организм, кем, где и когда он был собран, чем примечателен и для чего его можно использовать в науке и практике», - отмечается в сообщении пресс-службы.
Руководитель направления «Микроорганизмы и грибы» Алексей Соловченко отмечает, что система может хранить не только описание организмов, но и все методики работы с ними: как их культивировать, изучать и сохранять долгое время.
«Основной принцип работы системы — адаптивная форма паспорта образца, которая изначально вмещает минимум информации, присущей каждому образцу независимо от типа биоматериала и коллекции: данные о том, где и каким образом был получен образец, а также информацию о живом организме, из которого взят материал. Остальная часть паспорта настраивается так, чтобы оптимально и полно отражать сведения, специфичные для разных живых существ и единиц хранения, от бактерий до животных», — рассказал научный координатор проекта «Ноев ковчег», ведущий научный сотрудник биологического факультета МГУ Петр Каменский.
В системе также имеется возможность автоматической загрузки уже известных сведений о хранящихся организмах из авторитетных международных баз данных. Впоследствии система «обрастет» биоинформатическими сервисами, с помощью которых пользователи депозитария извлекут максимум пользы из хранящейся в нем информации и биоматериала.
Каждому образцу электронной системы для строгой упорядоченности был присвоен уникальный штрих-код, нанесенный непосредственно на образец, сфотографировав который можно моментально получить всю доступную по нему информацию.
Число образцов постоянно увеличивается. На данный момент загружено около 510 тысяч образцов, 500 тысяч из которых — гербарные образцы, а около 10 тысяч — подробно охарактеризованные микроорганизмы.
«Сейчас в системе находится 19 коллекций, процесс инвентаризации, оцифровки и загрузки данных продолжается. Физически коллекции Депозитария МГУ располагаются в тех лабораториях, в которых с ними работают. Если взять биологический факультет, то там находится как минимум сто коллекций. Раньше владельцы коллекций друг про друга знали мало, и, соответственно, пользоваться коллекциями могли только те люди, которые непосредственно с ними работали. С вводом в действие нашей информационной системы ситуация кардинально поменялась», — говорит Петр Каменский.
Актуальная версия депозитария живых систем доступна всем желающим.